Grupa została założona w listopadzie 2007 roku. Opiekunami grupy zostali Michał Wasielewski i Bartosz Kapsa.  Celem grupy jest walka w ligach środowiskowych w Gnieźnie. Reprezentowanie klubu w turniejach. Jednak głównym celem są Młodzieżowe Mistrzostwa Polski, a także bezpośrednie zaplecze grupy seniorskiej do której mają trafiać najzdolniejsi gracze U21.

Już po kilku tygodniach istnienia grupa zaliczyła pierwszy poważny występ. W połowie grudnia KS Gniezno uczestniczył w MMP do lat 21 rozgrywanych w Chojnicach i Człuchowie. Niestety w trzech meczach grupowych odnieśli trzy porażki (TPH Polkowice 1:5, Copacabana Gdańsk 0:5; Energy Ostrowiec Świętokrzyski 6:7).

12 kwietnia 2008 grupa osiągnęła jak dotąd największy sukces zdobywając tytuł wice mistrza Wielkopolski. W finale po rzutach karnych ulegli Radanowi Gliwice. W tyle zostały takie zespoły jak Akademia Słowa Poznań, Tacho Toruń czy Kanglida Gorzów Wielkopolski.

Na początku czerwca KS Gniezno wziął udział w Otwartych Mistrzostwach Pomorza i Kujaw. Turniej okazał się bardzo nieudany i KS odpadł w grupie.

Młodzi zawodnicy KS Gniezno zajęli dobre trzecie miejsce w lidze powiatowej.

Udało się również awansować do finałów MMP U-21. Jednak po zweryfikowaniu zawodów PZPN uznał 2 walkowery na niekorzyść naszego zespołu. 

W pierwszej lidze GTPNP po raz pierwszy jako grupa młodzieżowa KS Gniezno zajął piąte miejsce zdobywając 15 punktów. Utrzymanie w lidze zapewnili sobie w ostatnich kolejkach.

Obecnie U21 gra w lidze powiatowej na sztucznej trawie, a najważniejszą imprezą w tym sezonie są eliminacje Mistrzostw Polski U20, które odbędą się 11 listopada w Szczecinie.